Гуго Манизер родился 17 июня 1927 года в Ленинграде. Сын скульпторов Матвея Манизера и Елены Янсон-Манизер, дед Гуго — Генрих Манизер, также был художником.
Долгое время Гуго Матвеевич был преподавателем живописи в звании профессора, в Московском художественном институте имени В.И.Сурикова.
Гуго Матвеевич Манизер скончался 4 декабря 2016 года в возрасте 89 лет. Художника похоронили в Москве на Новодевичьем кладбище. Произведения Гуго Манизера хранятся в частных и государственных коллекциях России и других стран.